Diagnostické a testovacie prípravky na sekvenáciu pozitívnych vzoriek SARS-COV-2

Funkčná špecifikácia

Diagnostické a testovacie prípravky na sekvenáciu pozitívnych vzoriek SARS-COV-2

Technická špecifikácia textová

Technické vlastnosti: Etanol 96-100%, Hodnota / charakteristika: etanol pre molekulárnu biológiu, 96-100% čistota; Technické vlastnosti: Illumina COVIDSeq Test, Hodnota / charakteristika: Test na detekciu mutácií a charakterizáciu RNA z vírusu SARS-CoV-2 založený na NGS technológii, využívajúci upravenú verziu validovaného, verejne dostup. protokolu ARTIC multiplex PCR s 98 amplikónmi; Technické vlastnosti: -, Hodnota / charakteristika: určenými na amplifikáciu špec. sekvencií vírusu SARS-CoV-2 v kombinácii s osvedčenou technológiou sekvenovania Illumina. Súčasťou testu je interná kontrola pozostávajúca z ľudských 11 mRNA targetov.; Technické vlastnosti: IDT for Illumina PCR Indexes Sets 1-4 (384 indexes), Hodnota / charakteristika: Sety PCR indexov nevyhnutných pre prípravu sekvenačnej knižnice. Balenie obsahuje sety 1-4 po 96 indexov.; Technické vlastnosti: Sekvenačné primery v4, Hodnota / charakteristika: Set primerov nadizajnovaných podľa ARTIC V4 protokolu, ktorý obsahuje 99 amplikónov určených na amplifikáciu špecifických sekvencií vírusuSARS-CoV-2. Veľkosť balenia pokryje analýzu 384 vzoriek.; Technické vlastnosti: MiniSeq High Output Reagent Kit (300-cycles), Hodnota / charakteristika: Reagencie na sekvenovanie kompatibilné s nízkokapacit. sekvenátorom MiniSeq s maximálnou dĺžkou čítaní 150 bp a výstupom 3,75 Gb. Balenie obsahuje cartridge s reagenciami, buffer cartridge a flow cell; Technické vlastnosti: PhiX Control, Hodnota / charakteristika: Štandardná knižnica ligovaná s adaptérom používaná ako kontrola pre sekvenčné behy na Illumina platformách. Knižnica je odvodená z malého, dobre charakterizovaného genómu bakteriofága; Technické vlastnosti: Nuclease-free water for molecular biology, Hodnota / charakteristika: Voda pre molekulárnu biológiu, ultračistá, bez prítomnosti DNáz, RNáz, inhibítorov PCR; Technické vlastnosti: 1X dsDNA HS Assay kit, Hodnota / charakteristika: Kit na fluorometrické stanovenie koncentrácie dvojvláknových DNA molekúl, s vysokým rozlíšením, schopný detekovať DNA v koncentrácii od 0.005 do 120 ng/µl, kompatibilný s fluorometrom Qubit 4; Technické vlastnosti: QIAxcel DNA High Resolution Kit, Hodnota / charakteristika: Kit na kvantifikáciu DNA metódou kapilárnej elektroforézy, so schopnosťou rozlíšenia veľkostí fragmentov DNA s presnosťou 3-5 bp, umožňujúci analýzu 12 vzoriek v jednom behu, kompatibilný s kapilárnou; Technické vlastnosti: -, Hodnota / charakteristika: elektroforézou QIAxcel Advanced, balenie obsahujúce gélovú cartridge, pufre, minerálny olej, 12-jamkový strip, kalibračný marker a unikátny produktový kľúč.; Technické vlastnosti: QX Nitrogen Cylinder, Hodnota / charakteristika: Dusíkové bomby pre kapilárnu elektroforézu, kompatibilné s kapilárnou elektroforézou QIAxcel Advanced; Technické vlastnosti: Size Marker 50 bp – 1,5 kb, Hodnota / charakteristika: Marker pre kapilárnu elektroforézu, s veľkosťou fragmentov od 50 bp - 1,5 kb, na určenie veľkosti fragmentov DNA, kompatibilné s kapilárnou elektroforézou QIAxcel Advanced; Technické vlastnosti: Alignment Marker, Hodnota / charakteristika: Marker pre kapilárnu elektroforézu, na kalibráciu systému kapilárnej elektroforézy QIAxcel Advanced, 50bp/5 kb; Technické vlastnosti: QIAamp Viral RNA Mini Kit (250), Hodnota / charakteristika: Kity na izoláciu RNA vírusov založené na silika-membránovej technológii s využitím mikrocentrifugačných filtračných kolóniek, na ktoré sa viaže vírusová RNA. Izolačná súprava navrhnutá na izoláciu RNA; Technické vlastnosti: -, Hodnota / charakteristika: vírusov z rôznych druhov biologických vzoriek v tekutej forme: nasofaryngeálne výtery v odberovom médiu, plazma, sérum, a iné. Izolačný kit musí byť vhodný na manuálnu izoláciu nukleových kyselín zo; Technické vlastnosti: -, Hodnota / charakteristika: vzoriek biologického materiálu v laboratórnych podmienkach. Izolačný kit umožňuje aj automatizovanú extrakciu nukleových kyselín zariadením QIACube Connect. Izolované vzorky sú vhodné na ďalšiu; Technické vlastnosti: -, Hodnota / charakteristika: analýzu metódami molekulárnej biológie, ako je RT-PCR, bez prítomnosti kontaminácie a inhibítorov PCR reakcie, ktoré sú kompletne odstránené počas 2 premývacích krokov. Súčasťou kitu musí byť lyzačný; Technické vlastnosti: -, Hodnota / charakteristika: roztok, premývacie a elučné pufre a silika-membránové filtračné kolónky. Vstupný objem vzorky 140 µl. Obsah jedného balenia postačujúci na 250 vzoriek

Technická špecifikácia číselná

Technické vlastnosti: Etanol 96-100%, Jednotka: Liter, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 15; Technické vlastnosti: Illumina COVIDSeq Test, (balenie 1024 testov), Jednotka: balenie, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 1; Technické vlastnosti: IDT for Illumina PCR Indexes Sets 1-4 (384 indexes) balenie 384 index), Jednotka: balenie, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 4; Technické vlastnosti: Sekvenačné primery v4, (balenie 384 testov), Jednotka: balenie, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 4; Technické vlastnosti: MiniSeq High Output Reagent Kit (300-cycles), Jednotka: ks, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 17; Technické vlastnosti: PhiX Control, Jednotka: ks, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 8; Technické vlastnosti: Nuclease-free water for molecular biology, Jednotka: Liter, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 20; Technické vlastnosti: 1X dsDNA HS Assay kit, (balenie 100 rxns), Jednotka: balenie, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 4; Technické vlastnosti: QIAxcel DNA High Resolution Kit, (balenie 1200rxns), Jednotka: balenie, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 1; Technické vlastnosti: QX Nitrogen Cylinder, (balenie 6ks), Jednotka: balenie, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 1; Technické vlastnosti: Size Marker 50 bp – 1,5 kb, (balenie 100 µl), Jednotka: balenie, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 2; Technické vlastnosti: Alignment Marker, (balenie 1,5ml), Jednotka: balenie, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 2; Technické vlastnosti: QIAamp Viral RNA Mini Kit (250) balenie 250 testov), Jednotka: balenie, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 8