Opis obstarávania
Dodávka laboratórnej techniky a spotrebného materiálu v rámci Projektu: Centrum výskumu závažných ochorení a ich
komplikácií, v členení:
1) Spotrebný materiál:
1.1) štartovací kit vhodný na aplikácie masívneho paralelného sekvenovania na báze semikonduktorového sekvenovania:
6 ks,
1.2) čip s najnižšou kapacitou vhodný na masívne paralelné sekvenovanie na báze semikonduktorového sekvenovania:
10 ks,
1.3) čip so strednou kapacitou vhodný na masívne paralelné sekvenovanie na báze semikonduktorového sekvenovania:
8 ks,
1.4) čip s najvyššou kapacitou vhodný na masívne paralelné sekvenovanie na báze semikonduktorového sekvenovania:
12 ks,
1.5) kit obsahujúci reagencie nevyhnutné na amplifikáciu a prípravu knižníc, kompatibilný s komerčne dostupnými
prípravu knižníc, kompatibilný s komerčne dostupnými: 5 ks,
1.6) kit obsahujúci set primerov hodných na detekciu variantov v génoch pre hereditárne ochorenia: 8 ks,
1.7) panel na postsekvenčnú genotypizáciu ľudských SNP: 10 ks,
1.8) kit na štandardizáciu kvantity vzoriek pred analýzou: 6 ks,
1.9) kit s čiarovými adaptérmi pre multiplexné sekvenačné reakcie: 4 ks,
1.10) kit obsahujúci reagencie a plasty vhodné na sekvenačné analýyz na princípe semikonduktorového sekvenovania: 4
ks,
1.11) kit obsahujúci reagencie na prípravu templátu: 6 ks,
1.12) kit na izoláciu genomickej DNA z krvi: 60 ks,
1.13) spotrebný materiál potrebný k izolácii DNA: 2 ks,
1.14) Set na detekciu 6 nezávislých markerov na analýzu MSI-H fenotypu vrátane 5 mononukleotidových opakovaní
metódou real-time PCR: 40 ks,
1.15) Agaróza na elektroforetickú separáciu nukleových kyselín, bez DNázovej a RNázovej aktivityteplota topenia: 30 ks,
1.16) Akrylamid pre molekulárnu biológiu: 25 ks,
1.17) APS pre molekulárnu biológiu: 25 ks,
1.18) Bis-akrylamid pre molekulárnu biológiu: 24 ks,
1.19) DTT pre molekulárnu biológiu: 40 ks,
1.20) EDTA disodná soľ, dihydrát pre molekulárnu biológiu: 25 ks,
1.21) Glycín pre molekulárnu biológiu: 25 ks,
1.22) Guanidín hydrochlorid pre molekulárnu biológiu: 25 ks,
1.23) SDS pre molekulárnu biológiu: 25 ks,
1.24) Set dATP, dCTP, dGTP, dTTP, každý po 2 x 1,000l: 40 ks,
1.25) Tris base pre molekulárnu biológiu: 25 ks,
1.26) Náhodné hexadeoxynukleotidy pre klonovanie a syntézu prvého vlákna cDNA: 25 ks,
1.27) Oligo(dT) 15 primer pre syntézu prvého vlákna cDNA: 25 ks,
1.28) Hot Start polymeráza, 5u/l: 25 ks,
1.29) Reverzný transkripčný systém obsahujúci 5xreakčný pufor: 25 ks,
1.30) Systém pre kvantitatívnu analýzu RNA využitím dvojkrokového protokolu - reverzná transkripcia /kvantitatívna
PCR: 25 ks,
1.31) 10 x koncentrovaný TBE pufor pre polyakrylamidovú a agarózovú DNA elektroforézu, bez proteázovej, DNázovej a
RNázovej aktivitykyseliny boritej a 20mM EDTA, pH pri 25 oC (1X): 8,2 - 8,4: 20 ks,
1.32) EcoRI HC, 4080u/l: 18 ks,
1.33) HindIII HC, 4080u/l: 19 ks,
1.34) BamHI, 10u/l: 24 ks,
1.35) PstI,10u/l: 22 ks,
1.36) XbaI, 812u/l: 14 ks,
1.37) PvuI: 10 ks,
1.38) EcoRV, 10u/l: 24 ks,
1.39) NotI,10u/l: 15 ks,
1.40) PCR Master Mix (2x), Ready-to-use roztok obsahujúci Taq DNA polymerázu, dNTPs a MgCl2: 30 ks,
1.41) zmes Hot Start DNA polymerázy a Taq DNA polymerázy, pufru, dNTP a MgCl 2: 19 ks,
1.42) real-time PCR systém: 41 ks,
1.43) dvanásť fragmentov od 25bp do 300bp, 300bp band 3x intenzívnejší ako ostatné bandy, 100g, pre 55dráh,
0.36g/l: 18 ks,
1.44) trinásť fragmentov od 250bp do 10,000bp, zvýšená intenzita 1,000bp a 3,000bp fragmentu, 500l, pre 100 dráh,
0.1g/l: 19 ks,
1.45) 100bp DNA Ladder, Jedenásť fragmentov od 100bp do 1,000bp, 6X Blue/Orange Loading Dye: 20 ks,
1.46) Farbička obsahujúca 0.4% orange G, 0.03% bromophenol bluepremix na priame použitie, vhodné na nanášanie
DNA vzoriek na gél a sledovanie migrácie počas elektroforézy: 20 ks,
2) DNA analyzátor: 1 ks,
3) Pomocný analyzátor: 1 ks.
Popis požadovaných minimálnych vlastností jednotlivých položiek predmetu zákazky je vzhľadom na značný textový
rozsah, uvedený v Prílohe č. 4 súťažných podkladov. Spotrebný materiál podľa bodov 1.1 1.46 je uchádzač povinný
dodať s exspiračnou dobou tohto tovaru v trvaní minimálne 18 mesiacov (odo dňa dodania tovaru).
Súčasťou predmetu zákazky musia byť nasledovné služby:
- doprava predmetu zákazky na miesta plnenia uvedené v bode 6.1 časti A. Pokyny na vypracovanie ponuky,
- montáž a inštalácia zariadenia a všetkých potrebných častí k úspešnej inštalácii.
- uvedenie zariadenia do prevádzky,
- odskúšanie funkčnosti a prevádzkyschopnosti dodaného zariadenia,
- odovzdanie dokumentácie - technická dokumentácia, manuál pre obsluhu v slovenskom alebo českom jazyku,
- zaškolenie zamestnancov užívateľa na obsluhu dodaného zariadenia na mieste dodania, vrátane inštruktáže pre
rutinnú prevádzku a údržbu,
- servisné služby dostupné do 24 hodín.
