Funkčná špecifikácia
1) 2x premix pre prípravu master mixu pre RT-PCR, SYBR GreenER farbivo pre detekciu dvojvláknovej DNA, AmpliTaq polymeráza s hot-start mechanizmom a vysokou špecifickosťou, inaktívna pri pipetovaní pri izbovej teplote, tepelne labilná Uracil-DNA glykozyláza(UDG), pre odstránenie vplyvu kontaminantov–PCR produktov pochádzajúcich z amplifikácie, pri ktorej bol použitý dUTP,dUTP/dTTP–pre umožnenie aktivity UDG, vysoký dynamický rozsah 0.1pg-100 ng cDNA na reakciu, schopnosť detekovať jedinú kópiu genomickej DNA. ROX pasívna referencia, zmes dNTP s obsahom dUTP/dTTP.optimalizovaný tlmivý roztok; Možnosť použitia v prístroji Step One Plus (Applied Biosystems). - SYBR SELECT Master Mix 1x5ml v balení, päť (5) balení – ThermoFisher Scientific, Kat. č.4472908. Materiál je určený na molekulárno-biologické experimenty, ktoré boli robené na prístroji StepOne Plus a nové plánované stanovenia nadväzujú na predošlé. Preto nie je možné použiť inú náhradu.; 2) Kit na reverznú transkripciu širokého spektra RNA s vysokou citlivosťou. Využíva reverznú transkriptázu s vysokou afinitou na široké množstvo templátových RNA vrátane náročných sekvencií so sekundárnymi štruktúrami, čo je zabezpečené unikátnou stratégiou kombinácie primerov. Teplotné optimum reverznej transkriptázy oproti štandardným enzýmom je rozšírené na 42°C až 57°C pre RNA s vysokým obsahom GC. V jednej reakcii je možná reverzná transkripcia 1pg až 1μg RNA, pričom protokol je oproti štandardným reverzným transkriptázam skrátený až na 30min.; Súčasťou kitu je inhibítor DNA, ktorý degraduje možnú kontaminujúcu DNA z genomických zdrojov. Toto umožňuje realizovať RT reakciu spoločne s DN-ázovým ošetrením v jednom kroku, bez nutnosti ďalšieho použitia DNázy.- Verso cDNA Synthesis Kit (100 rekacií) – ThermoFisher Scientific, Kat. č. AB1453B. Materiál je určený na molekulárno-biologické experimenty, ktoré nadväzujú na predchádzajúce projekty. Preto nie je možné použiť inú náhradu.; 3) Molekulový štandard DNA 50bp vhodný pre určenie molekulovej veľkosti a zároveň odhad kvantity dvojvláknovej DNA na agarózovom alebo polyakrylamidovom géle. Molekulový štandard je zmesou chromatograficky purifikovaných DNA fragmentov o známej veľkosti od 50bp do 1000bp. Súčasťou balenia je detekčné farbivo na vzorky DNA v koncentrácii 6X. - GeneRuler 50bp DNA Ladder 50 μg (100 aplikácií), dve (2) balenia – ThermoFisher Scientific, Kat. č. SM0371. Materiál je určený na molekulárno-biologické experimenty, ktoré nadväzujú na predchádzajúce projekty. Preto nie je možné použiť inú náhradu.; 4) 2X premix pre prípravu mixu na PCR s DreamTaq polymerázou a so zeleným farbivom v pufrovacom roztoku, s obsahom MgCl2 a nukleotidov dNTP. Vhodný na PCR amplifikáciu genomickej DNA do veľkosti 6kb a virálnej DNA do veľkosti 20kb. Oproti štandardne používaným Taq polymerázam má vyššiu citlivosť, je schopný amplifikovať dlhšie PCR produkty, a to s vyššou výťažnosťou. Nevyžaduje optimalizáciu PCR reakcie.; Vďaka zelenému farbivu je možné PCR produkt naniesť priamo na agarózový gél. Inkorporuje aj modifikované nukleotidy okrem dUTP. - DreamTaq Green PCR Master Mix (2X) (200 reakcií) – ThermoFisher Scientific, Kat. č. K1081. Materiál je určený na molekulárno-biologické experimenty, ktoré nadväzujú na predchádzajúce projekty. Preto nie je možné použiť inú náhradu.; 5) 2X premix pre prípravu mixu na PCR s Phusion polymerázou vyznačujúcou sa vysokou reprodukovateľnosťou. Polymeráza Phusion ma cca 50-násobne nižšiu chybovosť ako bežná Taq polymeráza a 6-násobne nižšiu ako Pfu polymeráza. Preto je určená na vysoko citlivé PCR amplifikácie, ktoré vyžadujú vysokú spoľahlivosť (napr. pri produktoch určených na sekvenáciu, mikročipy alebo klonovanie atď). Vďaka skrátenému času extenzie môžu PCR amplifikácie prebiehať v zrýchlenom móde (15-30s/ kb).; Vynikajúca výkonnosť spoločne s minimálnou potrebou optimalizácie a s vysokým výťažkom PCR produktu zabezpečujú spoľahlivosť aj pri práci s dlhými templátovými DNA až do 20kb, a to aj pri sekvenciách s vysokým obsahom GC.- Phusion High-Fidelity DNA Polymerase (2 U/µL) (100 jednotiek) – ThermoFisher Scientific, Kat. č. F531S. Materiál je určený na molekulárno-biologické experimenty, ktoré nadväzujú na predchádzajúce projekty. Preto nie je možné použiť inú náhradu.
Technická špecifikácia textová
Technická špecifikácia číselná
