Chemikálie

Funkčná špecifikácia

Nákup nových, nepoužívaných komponentov vrátane balenia, dopravy, nákladov na manipuláciu, vyloženia na konkrétne pracovisko uvedené v objednávke a iných nákladov potrebných na realizáciu zákazky.; Objednávateľ u tovarov identifikovaných konkrétnym výrobcom, značkou alebo typom pripúšťa dodanie ekvivalentných tovarov s plnohodnotnými vlastnosťami na identické použitie v zmysle funkčnej a technickej špecifikácie a obvyklej praxe a zároveň so zabezpečením bezpodmienečnej kompatibility s laboratórnymi produktami, použitie ktorých je nevyhnutné s požadovanými tovarmi, a to bez nutnosti ďalších nákladov na strane objednávateľa.; V prípade ekvivalentných tovarov objednávateľ požaduje predložiť u každej ekvivalentnej položky bezplatnú vzorku, ktorá bude vyskúšaná pracoviskom objednávateľa pri práci v laboratóriu.; Zmluva – Rámcová dohoda sa uzatvára na dobu určitú, a to odo dňa nadobudnutia jej účinnosti na 12 kalendárnych mesiacov. Objednávateľ si vyhradzuje právo neobjednať maximálny rozsah predmetu zákazky.

Technická špecifikácia textová

Technické vlastnosti: 1. Enzymatická zmes určená na purifikáciu PCR produktov pred sekvenovaním. Musí umožniť odstránenie neinkorporovaných primerov a nukleoditov. Zmes sa musí skladať minimálne z dvoch enzýmov, a to z exonukleázy a z alkalickej fosfatázy alebo z enzýmov s rovnakými vlastnosťami. Musí umožniť purifikáciu len s jedným pipetovacím krokom, pre zrýchlenie reakčného toku a šetrenie času, minimalizáciu pipetovacích chýb. Maximálna doba reakcie 30 minút bez potreby manuálneho zásahu. Bez straty koncového produktu, t.j. s výťažkom 100%, Hodnota / charakteristika: Možnosť dávkovania do rôznych reakčných objemov podľa potrieb užívateľa. Balenie na 500 reakcií; Technické vlastnosti: 2. Formamid určený na prípravu vzoriek pre potreby fragmentovej analýzy a sekvenačných aplikácií uskutočnených pomocou automatizovanej kapilárnej elektroforézy. Vysoko deionizovaný formamid určený na účely elektrokinetickej injektáže vzoriek pri kapilárnej elektroforéze, Hodnota / charakteristika: Produkt musí byť kompatibilný so systémami pre kapilárnu elektroforézu spoločnosti Applied Biosystems. Balenie obsahuje 25 ml.; Technické vlastnosti: 3. Kit na rýchle a efektívne prečistenie sekvenačných reakcií. Kit musí efektívne odstrániť primery, dNTP a terminálne značenie. Procedúra musí byť založená na špecifickej väzbe izolovanej deoxyribonukleovej kyseliny na kolónku, ktorá nemusí byť hydratovaná, čím sa skracuje doba purifikácie na niekoľko minút. Kit musí byť kompatibilný s formátom štandardných 1.5 ml eppendorfových skúmaviek. Kit musí byť kompatibilný s purifikačnými kolónkami AmpliPurifi alebo ekvivalentnými kolónkami. Kit musí umožniť farebnú kontrolu úspešnej purifikácie., Hodnota / charakteristika: Balenie na prečistenie 250 vzoriek.; Technické vlastnosti: 4. TBE pufor na elektroforetickú analýzu.Balenie obsahuje 1000 ml 10x koncentrovaného roztoku., Hodnota / charakteristika: ; Technické vlastnosti: 5. Kit na uskutočnenie sekvenačnej reakcie vyhodnotiteľnej pomocou automatizovanej kapilárnej elektroforézy. Kit určený na stanovenie sekvencie cieľových oblastí DNA. Kit musí umožniť určenie všetkých štyroch deoxyribonukleotidov v jednej skúmavke využitím vylepšenej verzie Sangerovej metódy, tj. na základe zabudovania odlišne fluorescenčne značených dideoxinukleotidov do enzymaticky predlžovaného reťazca DNA., Hodnota / charakteristika: ; Technické vlastnosti: 5. Produkt musí byť optimalizovaný na analýzu sekvencie dlhších úsekov nukleových kyselín, na de novo sekvenovanie rôznych templátov ako napríklad plazmidov, alebo umelo vytvorených bakteriálnych chromozómov, a na analýzu sekvencie nukleových kyselín s vysokým obsahom GC párov alebo AT párov • Produkt musí obsahovať všetky chemikálie potrebé k uskutočneniu sekvenačnej reakcie okrem špecifických primerov, templátových molekúl a ultračistej vody. Kit bez potreby zavedenia nových spektrálnych matricových súborov na zariadeniach pre kapilárnu elektroforézu spoločnosti Applied Biosystems., Hodnota / charakteristika: ; Technické vlastnosti: 6. Štandardné DNA oligonukleotidy. Dĺžka do 30 báz. Škála syntézy 0.20 µmol. Prečistenie pomocou gélovej filtrácie zaručujúce čistotu aspoň 70%. Výťažok po prečistení aspoň 16 OD. Monitorovanie celého procesu syntézy dimethoxytrityl (DMT)-monitoringom (alebo ekvivalentnou metódou), s povolením pokračovania syntézy iba v prípade aspoň 98.5 % účinnosti daného kroku syntézy.Spektrofotometrická kontrola kvality a kvantity všetkých oligonukleotidov• Kontrola kvality všetkých alebo aspoň námatkovo vybraných oligonukleotidov pomocou vysokotlakej kvapalinovej chromatografie a hmotnostnej spektrometrie, Hodnota / charakteristika: Balenie 1 kus.; Technické vlastnosti: 7. Musí inhibovať aktivitu RNáz A, B a C ich väzbou nekompetitívnym spôsobom v pomere 1:1. Nesmie inhibovať eukaryotické RNázy T1, T2, U1, U2, CL3, ako ani prokaryotické RNázy I a H. Produkt musí vykazovať vysokú účinnosť v širokom rozsahu reakčných podmienok. Musí ochrániť RNA pred degradáciou pri teplotách aspoň do 55°C. Produkt musí vykazovať plný inhibičný účinok už pri koncentrácií 1 U/µL roztoku, Hodnota / charakteristika: Balenie obsahuje 10 000 U; Technické vlastnosti: 8. Vylepšená verzia M-MuLV reverznej transkriptázy alebo ekvivalentný enzým. Enzým musí mať RNA-závislú polymerázovú aktivitu a DNA-závislú polymerázovú aktivitu, ale nesmie mať aktivitu RNázy H. Enzým musí mať minimálne 50x vyššiu procesivitu, vyššiu robustnosť a zvýšenú rýchlosť syntézy v porovnaní s divokým typom M-MuLV reverznej transkriptázy. Enzým musí mať vysokú termostabilitu, musí byť schopná zachovania aspoň 90% enzýmovej aktivity po inkubácii pri 50 °C počas 60 minút a musí vykazovať vysokú enzýmovú aktivitu aspoň pri teplotách do 65°C., Hodnota / charakteristika: ; Technické vlastnosti: 8. Enzým musí poskytovať vysoké výťažky cDNA plnej dĺžky aj s templátmi s dĺžkou až do 20 kb. Musí umožniť uskutočnenie syntézy cDNA za 15 až 30 minút. Musí umožniť prácu v širokom rozsahu vstupného množstva vzorky a to v rozsahu minimálne od 1 pg po 5 µg.Musí umožniť zabudovanie modofokovaných nukleotidov. Produkt musí obsahovať enzým v koncentrácií aspoň 200 U/µl., Hodnota / charakteristika: Balenie obsahuje 40 000 U.; Technické vlastnosti: 9. Separačná matrica vhodná na uskutočnenie rôznych typov sekvenačných a fragmentových analýz prostredníctvom kapilárnej elektroforézy. Produkt musí byť vhodný na uskutočnenie sekvenačných a fragmentových analýz s krátkym aj dlhým odčítaním. Matrica musí umožniť dynamické obalenie vnútorného povrchu kapilár a efektívnu kontrolu elektroosmotického toku. Produkt s identifikačnou značkou fungujúcou na báze rádiových vĺn. Musí byť zaručene kompatibilná s prístrojmi radu 3500 Genetic Analyzers od firmy Applied Biosystems., Hodnota / charakteristika: ; Technické vlastnosti: 9. Životnosť produktu musí byť najmenej 7 dní v prípade otvorenia a pripojenia ku genetickému analyzátoru., Hodnota / charakteristika: Balenie obsahuje matricu pre analýzu 960 vzoriek.; Technické vlastnosti: 10. Roztok na údržbu pumpy slúžiacej na dávkovanie separačnej matrice u prístrojov radu 3500/3500xL Genetic Analyzers od firmy Applied Biosystems. Produkt musí obsahovať identifikačnú značku fungujúcu na báze rádiových vĺn z dôvodu umožnenia jeho identifikácie analyzátorom a potvrdenia platnej životnosti a iných parametrov produktu., Hodnota / charakteristika: Balenie obsahuje reagent na 1 použitie.; Technické vlastnosti: 11. Sada 8 kapilár s dĺžkou aspoň 36 cm, vhodných na bežné sekvenačné a fragmentové analýzy. Kapiláry musia mať neopracovaný vnútorný povrch a priemer 50 µm. Kapiláry musia byť umiestnené na plastovom ráme, určenom na jednoduchú výmenu kapilár. Musia byť kompatibilné s prístrojmi radu 3500 Genetic Analyzers od firmy Applied Biosystems. Životnosť každej z ôsmich kapilár musí byť najmenej 160 analýz., Hodnota / charakteristika: Balenie obsahuje sadu 8 kapilár.; Technické vlastnosti: 12. Súbor fragmentov dvojvláknovej DNA so známou molekulovou hmotnosťou a koncentráciou, vhodný ako štandard na určenie molekulovej hmotnosti a koncentrácie DNA fragmentov do veľkosti 5000 bp analyzovaných pomocou elektroforézy. Obsiahnuté štandardy musia byť vybrané tak aby sa medzi nimi vytvorili rovnomerné odstupy počas elektroforetickej separácie. Aspoň 2 štandardy molekulovej hmotnosti dvojvláknovej DNA musia byť prítomné vo výrazne vyššej koncentrácií ako ostatné štandardy z dôvodu zabezpečenia lahšej oriantácie a identifikácie jednotlivých štandradov., Hodnota / charakteristika: ; Technické vlastnosti: 12. Presne určená koncentrácia jednotlivých štandardov molekulovej hmotnosti dvojvláknovej DNA v rozmedzí koncentrácií aspoň 10 až 20 µg/ml umožňujúca denzitometrickú kvantifikáciu analyzovaných DNA fragmentov. Produkt musí byť vhodný na priame použitie bez potreby ďalšieho riedenia alebo pridania nanášacej zmesi., Hodnota / charakteristika: ; Technické vlastnosti: 12. V balení musí byť priložená koncentrovaná DNA nanášacia zmes obsahujúca aspoň 2 farbičky umožňujúce sledovanie priebehu elektroforetickej separácie. Produkt musí obsahovať požadované fragmenty v celkovej koncentrácii najmenej 0.1 µg/µl. Nesmie obsahovať stopy nukleáz. Produkt s životnosťou aspoň 6 mesiacov v prípade skladovania pri izbovej teplote", Hodnota / charakteristika: Balenie obsahuje fragmenty dvojvláknovej DNA v množstve 50 µg.

Technická špecifikácia číselná

Technické vlastnosti: 1. Illustra Exo Pro Star 1-Step, 500 reakcií (Cytiva), Jednotka: bal, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 5; Technické vlastnosti: 2. Hi-Di TM, Formamide, 25 ml (Thermo Fisher Scientific), Jednotka: bal, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 1; Technické vlastnosti: 3. AmpliPurifi ExTerminator Kit, 250 purifikácií (Amplia), Jednotka: bal, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 10; Technické vlastnosti: 4. 10 xTBE-buffer solution, for molecular biology, 1000 ml  (Thermo Fisher Scientific), Jednotka: bal, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 10; Technické vlastnosti: 5. BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit, 100 reakcií (Thermo Fisher Scientific), Jednotka: bal, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 2; Technické vlastnosti: 6. Primery (0.20 µmol, 16 OD, cca 30bp, HPSF prečistenie) (Eurofins Genomics), Jednotka: bal, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 4; Technické vlastnosti: 7. RiboLock RNase Inhibitor (40 U/µL), 4x2500 U (Thermo Fisher Scientific), Jednotka: bal, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 5; Technické vlastnosti: 8. Maxima H Minus Reverse Transcriptase (200 U/µL), 4 x 10,000 U (Thermo Fisher Scientific), Jednotka: bal, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 7; Technické vlastnosti: 9.  Polymer, for 3500/SeqStudio™ Flex (Thermo Fisher Scientific), Jednotka: bal, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 2; Technické vlastnosti: 10. Conditioning Reagent, for 3500/SeqStudio™ Flex (Thermo Fisher Scientific), Jednotka: bal, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 4; Technické vlastnosti: 11. Kapilára k sekvenátoru ABI Prism (Thermo Fisher Scientific), Jednotka: bal, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 2; Technické vlastnosti: 12. DNA 100bp Ladder (Thermo Fisher Scientific), Jednotka: bal, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 4