Obstarávanie

Sekvenčné reagencie na uskutočnenie čítanie génov asociovaných s onkologickým ochoreniami


Detaily obstarávania

Obstarávateľ:
Univerzita Komenského v Bratislave, Jesseniova lekárska fakulta Martin
Typ obstarávania:
Tovary
EU fondy:
Nie
Odhadovaná suma(Bez DPH):
2 975,00
Konečná suma(Bez DPH):
2 704,54
Zaplatené:
90.9%
Mena:
EUR
Hlavný CPV kód:
24960000-1
Elektronická aukcia:
Neuvedené
Opcie:
Neuvedené
Rámcová dohoda:
Nie
Použitý postup:
§ 110 ZVO
Jednotka:
Kompletný predmet zákazky
Množstvo:
1.0
Počet uzavretých zmlúv:
1

Ponuky vyhodnotené podľa

Kritérium:
Cena bez DPH

Opis obstarávania

Funkčná špecifikácia

1. Kit umožňuje analýzu 111 génov, ktoré sú spojené s rôznymi formami dedičných onkologických ochorení ako rakoviny prsníkov, rakoviny vaječníkov, rakoviny prostaty, rakoviny čriev, na analýzu familiárnej adenomatóznej polypózy, hamartomatóznej polypózy, juvenilnej polypózy, Peutzov-Jeghersovho syndrómu, Cowdenovho syndrómu, Bannayan-Riley-Ruvalcaba syndrómu, Fanconiho anémie a analýzu rakoviny endokrinných tkanív. Kit umožňuje prípravu knižnice za menej ako 9 hodín. Požadované vstupné množstvo genomickej DNA k vykonaniu analýzy je 50 ng a menej;; Kit musí mať interoperabilný index umožňujúci kombináciu s viacerými NGS analýzami GeneSG© na plaforme Illumina. Kit je CE-IVD validovaný na MiSeq, HiSeq a NextSeq prístroji. Kit obsahuje reagencie k príprave 12 vzoriek ako aj unikátny šifrovaný kľúč k bioanalýze 12 vzoriek cez online platformu s možnosťou vizualizácie cez CE-IVD nástroj GeneSystems© a možnosťou personalizovanej filtrácie dát na GeneSystems©. Garantovaná bioinformatická analýza sprocesovaných vzoriek musí vychádzať z aktuálnej verzie genómu Hg38;; Výsledky analýz jednotlivých vzoriek DNA musia poskytovať minimálne pokrytie cieľových génov 200x, pričom sa vylučuje čítanie mimo cieľových génov tzv. „off targets“ a čítanie zodpovedajúce duplicitám PCR, ktoré by mohli zvýšiť počet falošne pozitívnych výsledkov. Zároveň požadujeme aby sondy použité pri NGS analýze mali dĺžku 120nt, k zabezpečeniu čo najšpecifickejšej hybridizácie počas NGS analýzy. Kit musí spĺňať podmienky ISO13485 a AENOR certifikácie pod číslom GS-0001/2015. Kvalita SG-LV3658.; 2. Minimálny zoznam génov, ktoré je možné detegovať pomocou kitu: ACD, AIP, APC, ATM, ATR, AXIN2, BAP1, BARD1, BLM, BMPR1A, BRCA1, BRCA2, BRIP1, BUB1, CDH1, CDK4, CDKN1B, CDKN2A, CHEK2, DDB2, DICER1, DIS3L2, DKC1, ELANE, EPAS1, EPCAM, ERCC1, ERCC2, ERCC3, ERCC4, ERCC5, ERCC6, FANCA, FANCB, FANCC, FANCD2, FANCE, FANCF, FANCG, FANCI, FANCL, FANCM, FH, FLCN, G6PC3, GFI1, GREM1, HOXB13, JAGN1, KIF1B, KIT, MAX, MDH2, MEN1, MET, MITF;; MLH1, MNX1, MSH2, MSH6, MSR1, MUTYH, NBN, NF2, NFIX, NHP2, NOP10, NSD1, NTHL1, PALB2, PARN, PDGFRA, PMS1, POLD1, POLE, POLH, POT1, PRKAR1A, PTCH1, PTEN, RAD50, RAD51, RAD51C, RAD51D, RB1, RECQL, RECQL4, RET, RTEL1, SCG5, SLX4 SMAD4, SMARCA4, STK11, SUFU, TERC, TERT, TINF2, TMEM127, TP53, TSC1, TSC2, UBE2T, VHL, VPS45, WAS, WRN, WT1, XPA, XPC, XRCC2.; 3. Kit obsahuje v prvom separátnom balení: GeneSGKit Tagmentation buffer (280 ul), GeneSGKit Tagmentation Enzyme (33 ul), GeneSGKit 5xPCR buffer (330 ul), GeneSGKit PCR enzyme (30 ul), GeneSGKit dNTPs (17 ul), GeneSGKit Primer Mix (17 ul), DMSO (50 ul), Onco-GeneSGKit Probes (26 ul), GeneSGKit Hybridization Buffer (90 ul), GeneSGKit Blocker Mix (75 ul), GeneSGKit RNase Block (8 ul), GeneSGKit P7 indexing primer (1-12) (5 ul z každého), GeneSGKit P5 indexing primer (13-20) (5 ul z každého);; GeneSGKit Read Primer 1 (50 ul), GeneSGKit Read Primer 2 (50 ul) GeneSGKit Index Read Primer (50 ul). Skladuje sa pri -20°C.; 4. Kit obsahuje v druhom separátnom balení: GeneSGKit Stop Solution (450 ul), GeneSGKit Binding Buffer (11 ml), GeneSGKit Wash Buffer 1 (5 ml), GeneSGKit Wash Buffer 2 (10 ml). Skladuje sa pri izbovej teplote.

Technická špecifikácia textová

Technická špecifikácia číselná

Technické vlastnosti: NGS reagenčná súprava, Jednotka: set, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 12 vzoriek

Zoznam uzavretých zmlúv ku obstarávaniu

Ak je viac zmlúv ku jednému obstarávaniu platí nasledovné: V prípade, že sumy na jednotlivých zmluvách sa zhodujú navzájom a aj s celkovou sumou za obstarávanie, s najväčšou pravdepodobnosťou sa v čase uverejnenia ešte nevedelo presné rozdelenie súm pre jednotlivých dodávateľov, alebo sú zle vyplnené vo vestníku.
Dodávateľ Spomedzi uchádzačov Suma kontraktu DPH Mena Dátum uzavretia kontraktu Detaily
VIAGENE s.r.o. 1 2 975,00 10% EUR 6. December 2018 247233

Zoznam dokumentov ku obstarávaniu

Všetky dokumenty sú spárované podla čísla obstarávania z portálu UVO. V prípade, že sa jedná o rozdelené obstarávanie, môžu byť zobrazené všetky súvisiace dokumenty.
Žiadne dokumenty neboli nájdené!

Zoznam výsledkov obstarávaní

Pozor! Konečná suma je vypočítaná ako celková hodnota uzavretých zmlúv (po odpočítaní DPH) v rámci obstarávania. Ak nie sú správne vyplnené jednotlivé sumy, či DPH ku zmluvám vo vestníku, celková suma a aj pomer v % bude nesprávny. Všetky výpočty sú len informatívne.
Názov obstarávania Obstarávateľ Odhadovaná suma (Bez DPH) Konečná suma (Bez DPH) Zaplatené Mena Rok Typ EU fondy Počet zmlúv Úspešné

Zoznam vyhlásených obstarávaní

Názov obstarávania Obstarávateľ Suma obstarávania Suma obstarávania_hidden Mena Dátum zverejnenia Lehota na predkladanie ponúk EU fondy DT_hidden Lehota_hidden

Vyhľadávač v dokumentoch obstarávania

Vyhľadávač poskytuje full-text vyhľadávanie v dokumentoch, ktoré boli priložené ku aktuálnemu obstarávaniu. Z dôvodu kolísavej kvality vstupných dokumentov za správnosť údajov strojového spracovania neručíme. V prípade rámcovej zmluvy, či rozdeleného obstarávania môže jeden dokument patriť viacerým obstarávaniam.

Vyhľadávač v dokumentoch obstarávania je prémiová funkcia dostupná pri podpore 8 a viac eur mesačne na portáli Patreon. V prípade, že už ste podporovateľ, prihláste sa a funkcia sa vám odomkne.