1. Kit umožňuje analýzu 111 génov, ktoré sú spojené s rôznymi formami dedičných onkologických ochorení ako rakoviny prsníkov, rakoviny vaječníkov, rakoviny prostaty, rakoviny čriev, na analýzu familiárnej adenomatóznej polypózy, hamartomatóznej polypózy, juvenilnej polypózy, Peutzov-Jeghersovho syndrómu, Cowdenovho syndrómu, Bannayan-Riley-Ruvalcaba syndrómu, Fanconiho anémie a analýzu rakoviny endokrinných tkanív. Kit umožňuje prípravu knižnice za menej ako 9 hodín. Požadované vstupné množstvo genomickej DNA k vykonaniu analýzy je 50 ng a menej;; Kit musí mať interoperabilný index umožňujúci kombináciu s viacerými NGS analýzami GeneSG© na plaforme Illumina. Kit je CE-IVD validovaný na MiSeq, HiSeq a NextSeq prístroji. Kit obsahuje reagencie k príprave 12 vzoriek ako aj unikátny šifrovaný kľúč k bioanalýze 12 vzoriek cez online platformu s možnosťou vizualizácie cez CE-IVD nástroj GeneSystems© a možnosťou personalizovanej filtrácie dát na GeneSystems©. Garantovaná bioinformatická analýza sprocesovaných vzoriek musí vychádzať z aktuálnej verzie genómu Hg38;; Výsledky analýz jednotlivých vzoriek DNA musia poskytovať minimálne pokrytie cieľových génov 200x, pričom sa vylučuje čítanie mimo cieľových génov tzv. „off targets“ a čítanie zodpovedajúce duplicitám PCR, ktoré by mohli zvýšiť počet falošne pozitívnych výsledkov. Zároveň požadujeme aby sondy použité pri NGS analýze mali dĺžku 120nt, k zabezpečeniu čo najšpecifickejšej hybridizácie počas NGS analýzy. Kit musí spĺňať podmienky ISO13485 a AENOR certifikácie pod číslom GS-0001/2015. Kvalita SG-LV3658.; 2. Minimálny zoznam génov, ktoré je možné detegovať pomocou kitu: ACD, AIP, APC, ATM, ATR, AXIN2, BAP1, BARD1, BLM, BMPR1A, BRCA1, BRCA2, BRIP1, BUB1, CDH1, CDK4, CDKN1B, CDKN2A, CHEK2, DDB2, DICER1, DIS3L2, DKC1, ELANE, EPAS1, EPCAM, ERCC1, ERCC2, ERCC3, ERCC4, ERCC5, ERCC6, FANCA, FANCB, FANCC, FANCD2, FANCE, FANCF, FANCG, FANCI, FANCL, FANCM, FH, FLCN, G6PC3, GFI1, GREM1, HOXB13, JAGN1, KIF1B, KIT, MAX, MDH2, MEN1, MET, MITF;; MLH1, MNX1, MSH2, MSH6, MSR1, MUTYH, NBN, NF2, NFIX, NHP2, NOP10, NSD1, NTHL1, PALB2, PARN, PDGFRA, PMS1, POLD1, POLE, POLH, POT1, PRKAR1A, PTCH1, PTEN, RAD50, RAD51, RAD51C, RAD51D, RB1, RECQL, RECQL4, RET, RTEL1, SCG5, SLX4 SMAD4, SMARCA4, STK11, SUFU, TERC, TERT, TINF2, TMEM127, TP53, TSC1, TSC2, UBE2T, VHL, VPS45, WAS, WRN, WT1, XPA, XPC, XRCC2.; 3. Kit obsahuje v prvom separátnom balení: GeneSGKit Tagmentation buffer (280 ul), GeneSGKit Tagmentation Enzyme (33 ul), GeneSGKit 5xPCR buffer (330 ul), GeneSGKit PCR enzyme (30 ul), GeneSGKit dNTPs (17 ul), GeneSGKit Primer Mix (17 ul), DMSO (50 ul), Onco-GeneSGKit Probes (26 ul), GeneSGKit Hybridization Buffer (90 ul), GeneSGKit Blocker Mix (75 ul), GeneSGKit RNase Block (8 ul), GeneSGKit P7 indexing primer (1-12) (5 ul z každého), GeneSGKit P5 indexing primer (13-20) (5 ul z každého);; GeneSGKit Read Primer 1 (50 ul), GeneSGKit Read Primer 2 (50 ul) GeneSGKit Index Read Primer (50 ul). Skladuje sa pri -20°C.; 4. Kit obsahuje v druhom separátnom balení: GeneSGKit Stop Solution (450 ul), GeneSGKit Binding Buffer (11 ml), GeneSGKit Wash Buffer 1 (5 ml), GeneSGKit Wash Buffer 2 (10 ml). Skladuje sa pri izbovej teplote.
Technické vlastnosti: NGS reagenčná súprava, Jednotka: set, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 12 vzoriek
Dodávateľ | Spomedzi uchádzačov | Suma kontraktu | DPH | Mena | Dátum uzavretia kontraktu | Detaily |
---|---|---|---|---|---|---|
VIAGENE s.r.o. | 1 | 2 975,00 | 10% | EUR | 6. December 2018 |
Názov obstarávania | Obstarávateľ | Odhadovaná suma (Bez DPH) | Konečná suma (Bez DPH) | Zaplatené | Mena | Rok | Typ | EU fondy | Počet zmlúv | Úspešné |
---|
Názov obstarávania | Obstarávateľ | Suma obstarávania | Suma obstarávania_hidden | Mena | Dátum zverejnenia | Lehota na predkladanie ponúk | EU fondy | DT_hidden | Lehota_hidden |
---|
Vyhľadávač v dokumentoch obstarávania je prémiová funkcia dostupná pri podpore 8 a viac eur mesačne na portáli Patreon. V prípade, že už ste podporovateľ, prihláste sa a funkcia sa vám odomkne.