Funkčná špecifikácia
1. Kit na bisulfidovú modifikáciu (Epitect Bisulfide kit). 2 balenia. Kit umožňuje vykonať kompletnú konverziu nemetylovaných cytozínov na uracily v DNA a následnú purifikáciu v čase do 6 hodín. Kit zároveň poskytuje ochranu proti DNA degradácii, čo umožní zachovanie vysokej senzitivity aj z malého vstupného množstva DNA (až do 1 ng). Hodnoty konverzie s využitím daného kitu musia byť vysoké, v blízkom rozsahu 99%. 1 balenie=48 reakcii.; 2. Kompletne metylovaná DNA. 1 balenie.Metylovaná a a bisulfidom konvertovaná ľudská kontrolná DNA EpiTect. 1 balenie= 100 reakcií.; 3. Kompletne nemetylovaná DNA. 1 balenie.Nemetylovaná a bisulfidom konvertovaná ľudská kontrolná DNA EpiTect. 1 balenie= 100 reakcií.; 4. PyroMark Q96 Cartridge. 1 balenie. Plastový kartridž s ihličkami na spodnej strane, slúži na dodanie nukleotidov, enzýmov a substrátov do platničky na použitie s PyroMark Q96 ID. 1 balenie= 3 ks.; 5. PyroMark Q96 Plate Low (100). 1 balenie.Vysokokvalitné nízke 96-jamkové platničky s plochým dnom špecifické pre prístroj PyroMark Q96 ID, ktoré sa vkladajú priamo do pyrosekvenátora. 1 balenie= 100 kusov.; 6. Premývací pufor (PyroMark Wash Buffer, conc., 200 ml). 1 balenie.Premývací pufor potrebný na premytie vzoriek naviazaných na filter ihličiek vákuovej pumpy počas prípravy vzoriek na pyrosekvenáciu; - špecifické pre prístroj PyroMark Q96 ID; - koncentrovaný. Roztok slúži na premývanie a neutralizáciu imobilizovanej DNA. Premývací pufor musí byť kompatibilný a využiteľný s vákuovou pracovnou stanicou Pyromark Q96 ID. 1 balenie= 200 ml.; 7. Anelačný pufor (Annealing buffer). 1 balenie.Anelačný pufor slúži na naviazanie sekvenčného primera na DNA templát počas prípravy vzoriek na pyrosekvenačnú analýzu. Pufor musí byť kompatibilný a využiteľný s vákuovou pracovnou stanicou Pyromark Q96 ID a chemikáliami určenými na pyrosekvenovanie na tomto prístroji. 1balenie = 250ml; 8. Väzobný pufor (Biding buffer). 1 balenie.Väzobný pufor slúži na naviazanie biotinylizovanéhoc PCR produktu na sefarózové guličky počas prípravy reakcie na pyrosekvenovanie. Pufor musí byť kompatibilný a využiteľný s vákuovou pracovnou stanicou Pyromark Q96 ID a chemikáliami určenými na pyrosekvenovanie na tomto prístroji. 1 balenie = 200ml.; 9. PyroMark denaturačný roztok (Denaturation solution). 2 balenia.PyroMark denaturačný roztok potrebný k denaturácii dvojvláknového PCR produktu do jednoreťazcového templátu DNA v priebehu pyrosekvenačnej analýzy. 1 balenie= 500 ml.; 10. Hs_CpG assay (MAL) pre metylačnú analýzu. 1 balenie. Komerčne navrhnutá CpG assay: PCR a sekvenačný primer vhodný pre pyrosekvenačné analýzy génovo špecifických CpG metylačných ostrovčekov v géne MAL (CpG Hs_MAL_01_PM PyroMark CpG Assay) po DNA bisulfidovej konverzii (PM00062202). Preddefinované PCR a sekvenačné primery určené na analýzu vybraného úseku ľudského génu, využívajú konštrukčný algoritmus pre úspešné výsledky CpG metylácie;; Assay poskytuje dostatočné pokrytie CpG metylačných ostrovčekov cieľovej sekvencie určenej na analýzu vybraného úseku daného génu u ľudí. Assay musí byť využiteľná a kompatibilná s prístrojom PyroMark Q96 ID. 1 balenie na analýzu na 200 vzoriek.; 11. Hs_CpG assay (CADM1_01) pre metylačnú analýzu. 1 balenie. Komerčne navrhnutá CpG assay: PCR a sekvenačný primer vhodný pre pyrosekvenačné analýzy génovo špecifických CpG metylačných ostrovčekov v géne CADM1 (CpG Hs_CADM1_01_PM PyroMark CpG Assay) po DNA bisulfidovej konverzii (PM00062202). Preddefinované PCR a sekvenačné primery určené na analýzu vybraného úseku ľudského génu, využívajú konštrukčný algoritmus pre úspešné výsledky CpG metylácie;; Assay poskytuje dostatočné pokrytie CpG metylačných ostrovčekov cieľovej sekvencie určenej na analýzu vybraného úseku daného génu u ľudí. Assay musí byť využiteľná a kompatibilná s prístrojom PyroMark Q96 ID. 1 balenie na analýzu na 200 vzoriek.; 12. Hs_CpG assay (CALR_01) pre metylačnú analýzu. 1 balenie. Komerčne navrhnutá CpG assay: PCR a sekvenačný primer vhodný pre pyrosekvenačné analýzy génovo špecifických CpG metylačných ostrovčekov v géne CALR (CpG Hs_CALR_01_PM PyroMark CpG Assay) po DNA bisulfidovej konverzii (PM00077322). Preddefinované PCR a sekvenačné primery určené na analýzu vybraného úseku ľudského génu, využívajú konštrukčný algoritmus pre úspešné výsledky CpG metylácie;; Assay poskytuje dostatočné pokrytie CpG metylačných ostrovčekov cieľovej sekvencie určenej na analýzu vybraného úseku daného génu u ľudí. Assay musí byť využiteľná a kompatibilná s prístrojom PyroMark Q96 ID. 1 balenie na analýzu na 200 vzoriek.; 13. Hs_CpG assay (CALR_02) pre metylačnú analýzu. 1 balenie. Komerčne navrhnutá CpG assay: PCR a sekvenačný primer vhodný pre pyrosekvenačné analýzy génovo špecifických CpG metylačných ostrovčekov v géne CALR (CpG Hs_CALR_02_PM PyroMark CpG Assay) po DNA bisulfidovej konverzii (PM00077329). Preddefinované PCR a sekvenačné primery určené na analýzu vybraného úseku ľudského génu, využívajú konštrukčný algoritmus pre úspešné výsledky CpG metylácie;; Assay poskytuje dostatočné pokrytie CpG metylačných ostrovčekov cieľovej sekvencie určenej na analýzu vybraného úseku daného génu u ľudí. Assay musí byť využiteľná a kompatibilná s prístrojom PyroMark Q96 ID. 1 balenie na analýzu na 200 vzoriek.; 14. Hs_CpG assay (MGMT_01) pre metylačnú analýzu. 1 balenie. Komerčne navrhnutá CpG assay: PCR a sekvenačný primer vhodný pre pyrosekvenačné analýzy génovo špecifických CpG metylačných ostrovčekov v géne MGMT (CpG Hs_MGMT_01_PM PyroMark CpG Assay) po DNA bisulfidovej konverzii (PM00149702). Preddefinované PCR a sekvenačné primery určené na analýzu vybraného úseku ľudského génu, využívajú konštrukčný algoritmus pre úspešné výsledky CpG metylácie;; Assay poskytuje dostatočné pokrytie CpG metylačných ostrovčekov cieľovej sekvencie určenej na analýzu vybraného úseku daného génu u ľudí. Assay musí byť využiteľná a kompatibilná s prístrojom PyroMark Q96 ID. 1 balenie na analýzu na 200 vzoriek.; 15. Hs_CpG assay (ADAMTS16_01) pre metylačnú analýzu. 1 balenie. Komerčne navrhnutá CpG assay: PCR a sekvenačný primer vhodný pre pyrosekvenačné analýzy génovo špecifických CpG metylačných ostrovčekov v géne ADAMTS16 (CpG Hs_ADAMTS16_01_PM PyroMark CpG Assay) po DNA bisulfidovej konverzii (PM00022106). Preddefinované PCR a sekvenačné primery určené na analýzu vybraného úseku ľudského génu, využívajú konštrukčný algoritmus pre úspešné výsledky CpG metylácie;; Assay poskytuje dostatočné pokrytie CpG metylačných ostrovčekov cieľovej sekvencie určenej na analýzu vybraného úseku daného génu u ľudí. Assay musí byť využiteľná a kompatibilná s prístrojom PyroMark Q96 ID. 1 balenie na analýzu na 200 vzoriek.; 16. Kit pre PCR prípravu na pyrosekvenačné analýzy. 1 balenie.Súčasťou kitu je Master mix, 10x Coral load concentrate, 5xQ-roztok, 25mM MgCl2 a RNase-Free H2O. Master mix umožňuje špecifickú amplifikáciu genómovej DNA po bisulfidovej konverzii a zároveň zabraňuje hromadeniu prebytku biotinylovaného primeru a minimalizuje generovanie artefaktov čím poskytne vysoké výťažky špecifických PCR produktov a spoľahlivý výsledok pyrosekvenácie. Kit musí byť kompatibilný s chemikáliami a materiálom prístroja PyroMark Q96 ID. 1 balenie= 800 reakcii.; 17. Reagencie na pyrosekvenovanie (PyroMark Gold Q96 Reagents, 5 x 96). 1 balenie.Reagencie (lyofilizovaná zmes substrátov, zmes enzýmov, súbor nukleotidov) o koncentrácii 5x96 na prípravu pyrosekvenačnej reakcie na následnú metylačnú analýzu. Zmes je kompatibilná s kazetou (kartridž), ktorá slúži na vstrekovanie jednotlivých nukleotidov a substrátov do vopred pripravenej pyrosekvenačnej platničky. Kit musí byť kompatibilný s prístrojom PyroMark Q96 ID.1 balenie= 5x96.
Technická špecifikácia textová
Technická špecifikácia číselná