Obstarávanie

Chémia a plasty na pyrosekvenáciu


Detaily obstarávania

Obstarávateľ:
Univerzita Komenského v Bratislave, Jesseniova lekárska fakulta Martin
Typ obstarávania:
Tovary
EU fondy:
Nie
Odhadovaná suma(Bez DPH):
3 729,60
Konečná suma(Bez DPH):
3 729,60
Zaplatené:
100.0%
Mena:
EUR
Hlavný CPV kód:
19520000-7
Elektronická aukcia:
Neuvedené
Opcie:
Neuvedené
Rámcová dohoda:
Nie
Použitý postup:
§ 110 ZVO
Jednotka:
Kompletný predmet zákazky
Množstvo:
1.0
Počet uzavretých zmlúv:
1

Ponuky vyhodnotené podľa

Kritérium:
Cena bez DPH

Opis obstarávania

Funkčná špecifikácia

1. Kit na bisulfidovú modifikáciu (Epitect Bisulfide kit). 2 balenia. Kit umožňuje vykonať kompletnú konverziu nemetylovaných cytozínov na uracily v DNA a následnú purifikáciu v čase do 6 hodín. Kit zároveň poskytuje ochranu proti DNA degradácii, čo umožní zachovanie vysokej senzitivity aj z malého vstupného množstva DNA (až do 1 ng). Hodnoty konverzie s využitím daného kitu musia byť vysoké, v blízkom rozsahu 99%. 1 balenie=48 reakcii.; 2. Kompletne metylovaná DNA. 1 balenie.Metylovaná a a bisulfidom konvertovaná ľudská kontrolná DNA EpiTect. 1 balenie= 100 reakcií.; 3. Kompletne nemetylovaná DNA. 1 balenie.Nemetylovaná a bisulfidom konvertovaná ľudská kontrolná DNA EpiTect. 1 balenie= 100 reakcií.; 4. PyroMark Q96 Cartridge. 1 balenie. Plastový kartridž s ihličkami na spodnej strane, slúži na dodanie nukleotidov, enzýmov a substrátov do platničky na použitie s PyroMark Q96 ID. 1 balenie= 3 ks.; 5. PyroMark Q96 Plate Low (100). 1 balenie.Vysokokvalitné nízke 96-jamkové platničky s plochým dnom špecifické pre prístroj PyroMark Q96 ID, ktoré sa vkladajú priamo do pyrosekvenátora. 1 balenie= 100 kusov.; 6. Premývací pufor (PyroMark Wash Buffer, conc., 200 ml). 1 balenie.Premývací pufor potrebný na premytie vzoriek naviazaných na filter ihličiek vákuovej pumpy počas prípravy vzoriek na pyrosekvenáciu; - špecifické pre prístroj PyroMark Q96 ID; - koncentrovaný. Roztok slúži na premývanie a neutralizáciu imobilizovanej DNA. Premývací pufor musí byť kompatibilný a využiteľný s vákuovou pracovnou stanicou Pyromark Q96 ID. 1 balenie= 200 ml.; 7. Anelačný pufor (Annealing buffer). 1 balenie.Anelačný pufor slúži na naviazanie sekvenčného primera na DNA templát počas prípravy vzoriek na pyrosekvenačnú analýzu. Pufor musí byť kompatibilný a využiteľný s vákuovou pracovnou stanicou Pyromark Q96 ID a chemikáliami určenými na pyrosekvenovanie na tomto prístroji. 1balenie = 250ml; 8. Väzobný pufor (Biding buffer). 1 balenie.Väzobný pufor slúži na naviazanie biotinylizovanéhoc PCR produktu na sefarózové guličky počas prípravy reakcie na pyrosekvenovanie. Pufor musí byť kompatibilný a využiteľný s vákuovou pracovnou stanicou Pyromark Q96 ID a chemikáliami určenými na pyrosekvenovanie na tomto prístroji. 1 balenie = 200ml.; 9. PyroMark denaturačný roztok (Denaturation solution). 2 balenia.PyroMark denaturačný roztok potrebný k denaturácii dvojvláknového PCR produktu do jednoreťazcového templátu DNA v priebehu pyrosekvenačnej analýzy. 1 balenie= 500 ml.; 10. Hs_CpG assay (MAL) pre metylačnú analýzu. 1 balenie. Komerčne navrhnutá CpG assay: PCR a sekvenačný primer vhodný pre pyrosekvenačné analýzy génovo špecifických CpG metylačných ostrovčekov v géne MAL (CpG Hs_MAL_01_PM PyroMark CpG Assay) po DNA bisulfidovej konverzii (PM00062202). Preddefinované PCR a sekvenačné primery určené na analýzu vybraného úseku ľudského génu, využívajú konštrukčný algoritmus pre úspešné výsledky CpG metylácie;; Assay poskytuje dostatočné pokrytie CpG metylačných ostrovčekov cieľovej sekvencie určenej na analýzu vybraného úseku daného génu u ľudí. Assay musí byť využiteľná a kompatibilná s prístrojom PyroMark Q96 ID.  1 balenie na analýzu na 200 vzoriek.; 11. Hs_CpG assay (CADM1_01) pre metylačnú analýzu. 1 balenie. Komerčne navrhnutá CpG assay: PCR a sekvenačný primer vhodný pre pyrosekvenačné analýzy génovo špecifických CpG metylačných ostrovčekov v géne CADM1 (CpG Hs_CADM1_01_PM PyroMark CpG Assay) po DNA bisulfidovej konverzii (PM00062202). Preddefinované PCR a sekvenačné primery určené na analýzu vybraného úseku ľudského génu, využívajú konštrukčný algoritmus pre úspešné výsledky CpG metylácie;; Assay poskytuje dostatočné pokrytie CpG metylačných ostrovčekov cieľovej sekvencie určenej na analýzu vybraného úseku daného génu u ľudí. Assay musí byť využiteľná a kompatibilná s prístrojom PyroMark Q96 ID. 1 balenie na analýzu na 200 vzoriek.; 12. Hs_CpG assay (CALR_01) pre metylačnú analýzu. 1 balenie. Komerčne navrhnutá CpG assay: PCR a sekvenačný primer vhodný pre pyrosekvenačné analýzy génovo špecifických CpG metylačných ostrovčekov v géne CALR (CpG Hs_CALR_01_PM PyroMark CpG Assay) po DNA bisulfidovej konverzii (PM00077322). Preddefinované PCR a sekvenačné primery určené na analýzu vybraného úseku ľudského génu, využívajú konštrukčný algoritmus pre úspešné výsledky CpG metylácie;; Assay poskytuje dostatočné pokrytie CpG metylačných ostrovčekov cieľovej sekvencie určenej na analýzu vybraného úseku daného génu u ľudí. Assay musí byť využiteľná a kompatibilná s prístrojom PyroMark Q96 ID. 1 balenie na analýzu na 200 vzoriek.; 13. Hs_CpG assay (CALR_02) pre metylačnú analýzu. 1 balenie. Komerčne navrhnutá CpG assay: PCR a sekvenačný primer vhodný pre pyrosekvenačné analýzy génovo špecifických CpG metylačných ostrovčekov v géne CALR (CpG Hs_CALR_02_PM PyroMark CpG Assay) po DNA bisulfidovej konverzii (PM00077329). Preddefinované PCR a sekvenačné primery určené na analýzu vybraného úseku ľudského génu, využívajú konštrukčný algoritmus pre úspešné výsledky CpG metylácie;; Assay poskytuje dostatočné pokrytie CpG metylačných ostrovčekov cieľovej sekvencie určenej na analýzu vybraného úseku daného génu u ľudí. Assay musí byť využiteľná a kompatibilná s prístrojom PyroMark Q96 ID. 1 balenie na analýzu na 200 vzoriek.; 14. Hs_CpG assay (MGMT_01) pre metylačnú analýzu. 1 balenie. Komerčne navrhnutá CpG assay: PCR a sekvenačný primer vhodný pre pyrosekvenačné analýzy génovo špecifických CpG metylačných ostrovčekov v géne MGMT (CpG Hs_MGMT_01_PM PyroMark CpG Assay) po DNA bisulfidovej konverzii (PM00149702). Preddefinované PCR a sekvenačné primery určené na analýzu vybraného úseku ľudského génu, využívajú konštrukčný algoritmus pre úspešné výsledky CpG metylácie;; Assay poskytuje dostatočné pokrytie CpG metylačných ostrovčekov cieľovej sekvencie určenej na analýzu vybraného úseku daného génu u ľudí. Assay musí byť využiteľná a kompatibilná s prístrojom PyroMark Q96 ID. 1 balenie na analýzu na 200 vzoriek.; 15. Hs_CpG assay (ADAMTS16_01) pre metylačnú analýzu. 1 balenie. Komerčne navrhnutá CpG assay: PCR a sekvenačný primer vhodný pre pyrosekvenačné analýzy génovo špecifických CpG metylačných ostrovčekov v géne ADAMTS16 (CpG Hs_ADAMTS16_01_PM PyroMark CpG Assay) po DNA bisulfidovej konverzii (PM00022106). Preddefinované PCR a sekvenačné primery určené na analýzu vybraného úseku ľudského génu, využívajú konštrukčný algoritmus pre úspešné výsledky CpG metylácie;; Assay poskytuje dostatočné pokrytie CpG metylačných ostrovčekov cieľovej sekvencie určenej na analýzu vybraného úseku daného génu u ľudí. Assay musí byť využiteľná a kompatibilná s prístrojom PyroMark Q96 ID. 1 balenie na analýzu na 200 vzoriek.; 16. Kit pre PCR prípravu na pyrosekvenačné analýzy. 1 balenie.Súčasťou kitu je Master mix, 10x Coral load concentrate, 5xQ-roztok, 25mM MgCl2 a RNase-Free H2O. Master mix umožňuje špecifickú amplifikáciu genómovej DNA po bisulfidovej konverzii a zároveň zabraňuje hromadeniu prebytku biotinylovaného primeru a minimalizuje generovanie artefaktov čím poskytne vysoké výťažky špecifických PCR produktov a spoľahlivý výsledok pyrosekvenácie. Kit musí byť kompatibilný s chemikáliami a materiálom prístroja PyroMark Q96 ID. 1 balenie= 800 reakcii.; 17. Reagencie na pyrosekvenovanie (PyroMark Gold Q96 Reagents, 5 x 96). 1 balenie.Reagencie (lyofilizovaná zmes substrátov, zmes enzýmov, súbor nukleotidov) o koncentrácii 5x96 na prípravu pyrosekvenačnej reakcie na následnú metylačnú analýzu. Zmes je kompatibilná s kazetou (kartridž), ktorá slúži na vstrekovanie jednotlivých nukleotidov a substrátov do vopred pripravenej pyrosekvenačnej platničky. Kit musí byť kompatibilný s prístrojom PyroMark Q96 ID.1 balenie= 5x96.

Technická špecifikácia textová

Technická špecifikácia číselná

Zoznam uzavretých zmlúv ku obstarávaniu

Ak je viac zmlúv ku jednému obstarávaniu platí nasledovné: V prípade, že sumy na jednotlivých zmluvách sa zhodujú navzájom a aj s celkovou sumou za obstarávanie, s najväčšou pravdepodobnosťou sa v čase uverejnenia ešte nevedelo presné rozdelenie súm pre jednotlivých dodávateľov, alebo sú zle vyplnené vo vestníku.
Dodávateľ Spomedzi uchádzačov Suma kontraktu DPH Mena Dátum uzavretia kontraktu Detaily
DYNEX Servis, spol. s r.o. 1 3 729,60 0% EUR 19. Október 2018 250059

Zoznam dokumentov ku obstarávaniu

Všetky dokumenty sú spárované podla čísla obstarávania z portálu UVO. V prípade, že sa jedná o rozdelené obstarávanie, môžu byť zobrazené všetky súvisiace dokumenty.
Žiadne dokumenty neboli nájdené!

Zoznam výsledkov obstarávaní

Pozor! Konečná suma je vypočítaná ako celková hodnota uzavretých zmlúv (po odpočítaní DPH) v rámci obstarávania. Ak nie sú správne vyplnené jednotlivé sumy, či DPH ku zmluvám vo vestníku, celková suma a aj pomer v % bude nesprávny. Všetky výpočty sú len informatívne.
Názov obstarávania Obstarávateľ Odhadovaná suma (Bez DPH) Konečná suma (Bez DPH) Zaplatené Mena Rok Typ EU fondy Počet zmlúv Úspešné

Zoznam vyhlásených obstarávaní

Názov obstarávania Obstarávateľ Suma obstarávania Suma obstarávania_hidden Mena Dátum zverejnenia Lehota na predkladanie ponúk EU fondy DT_hidden Lehota_hidden

Vyhľadávač v dokumentoch obstarávania

Vyhľadávač poskytuje full-text vyhľadávanie v dokumentoch, ktoré boli priložené ku aktuálnemu obstarávaniu. Z dôvodu kolísavej kvality vstupných dokumentov za správnosť údajov strojového spracovania neručíme. V prípade rámcovej zmluvy, či rozdeleného obstarávania môže jeden dokument patriť viacerým obstarávaniam.

Vyhľadávač v dokumentoch obstarávania je prémiová funkcia dostupná pri podpore 8 a viac eur mesačne na portáli Patreon. V prípade, že už ste podporovateľ, prihláste sa a funkcia sa vám odomkne.